Hola hace muuuuucho que trabaje con cubase, asi que no te puedo hablar de las últimas versiones, pero sí steinberg ha evolucionado a la par que los demas secuenciadores virtuales, supongo que el proceso de grabacion midi es muy similar.
Por tanto si lo que tu quieres es enviar los impuldos midi de, por ejemplo un secuenciador hardware o una caja de ritmos lo que tienes que hacer es: ya creados los canles midi asignar en las entradas el canal correspondiente , asi como la salida, por ejemplo en el canal midi 1 de cubase asignas de input el canal 2 de tu caja de ritmos y en el output el mismo canal 2 u otro que quieras y asi consecutivamente.
Pero si son vsti creo que la cosa se complica por que tendrias que tener la misma contidad de controladores midi que canales con un sinte virtual, a menos que tu controlador te permita seccionar el teclado y a cada seccion asignar un canal, la verdad eso solo lo he visto en live y aun asi creo que tendrias limitantes en las octavacion.
.
.